Il Whiskey invecchiato ha subito la maggior parte dei suoi cambiamenti chimici durante l'invecchiamento in botte. È stato ossidato e condensato. Il prodotto finale è generalmente stabile, tuttavia l'ulteriore evaporazione dei liquidi si verificherà nel tempo proprio come nel processo di invecchiamento in botte, per cui si consiglia di conservarlo in contenitori ermetici.
La luce del sole è nota per aumentare la quantità di sostanze come l'idrossimetilfurfurolo nelle bevande alcoliche immagazzinate come l'idromele e il vino. Non ho letto alcuno studio in diretta correlazione con il whisky, ma con lo zucchero residuo presente la produzione sembra probabile, quindi la conservazione al buio, o la luce non UV sarebbe probabilmente anche un positivo per la conservazione a lungo termine.
La stabilità a scaffale del whisky, soprattutto se sigillato, bypasserà quella del vino fornendo uno degli ambienti più difficili per qualsiasi tipo di organismo di deterioramento a prendere piede, con il suo alto contenuto di etanolo, oltre ad essere più acido di molti liquori più neutri come la vodka.